El peròxid d’hidrogen de qualitat alimentària és un desinfectant d’alta eficiència i ampli espectre de l’ordre dels desinfectants. Com que no deixa residus nocius després de la desinfecció i l’esterilització, s’ha convertit en un aliment segur, verd i saludable.
Les molècules d’hidroxil del peròxid d’hidrogen de qualitat alimentària i els seus derivats poden actuar directament sobre la membrana estructural externa dels bacteris, destruint la barrera de permeabilitat dels bacteris i destruint el sistema d’equilibri de materials dins i fora dels bacteris i causant la mort. Les molècules d’hidroxil lliures de peròxid d’hidrogen poden reaccionar directament amb les proteïnes i els àcids nucleics dels microorganismes, provocant la destrucció de la seva estructura i la mort.
Els estudis també han descobert que els productes de descomposició del peròxid d’hidrogen poden inhibir el sistema enzimàtic bacterià i reaccionar amb els aminoàcids de la cadena proteica enzimàtica.